基层供销社存在的主要问题是根植于农村服务农民保障农业方面做的不够好。所以在乡镇振兴战略上必须明确自己的主业发挥生力军作用，一是以市场为导向发挥好自己的政策优势。二是根植农村服务农民，为农民所盼所想所做。三是当好大农业的＂后勤部＂，为农业产前产中产后提供坚强的后勤保障。
供销社是过去计划经济时代物资匮乏时期而国家成立的供应人民日常生活用品的单位，为稳定国家经济，保障人民生活起到了非常重要的作用。
改革开放后，国家经济发展取得了举世瞩目的成就，物资基础得到根本改变，人们可以在市场上买到任何需要的日常生活用品，所以供销社的职能越来越弱，直到被社会淘汰。但是当国家遇到特别重大事情变化的情况下，还是要启动供销社进行保障供应的职能的。
