1、颜色
为橘红色，一段时间后，檀受到空气的氧化会变成紫红或紫黑，初步鉴别可以使用棉布沾一点酒精擦拭小叶紫檀，会看到有橘红色“喷涌”而出。如果用檀在在纸上划线会划出红色的划痕。这两点还不能准确鉴定檀的真伪。
2、密度
檀的密度是极高的，放在手上会觉得很重很压手，如果是手串，珠子之间的碰撞声音也会有玉石相撞之感，将檀木料放进水里，檀会沉到水底，不过这种鉴别方法稍具破坏性。
3、檀的表层都会有多多少少的牛毛纹，鉴别时可以拿一放大镜观察，较好的檀还会负载一些金星，光线充足的情况下可见。
4、油性
檀具有超高的油性，放置一段时间的檀手串，只要稍加把玩，就能使珠子快速析出油脂，将珠子的棕眼填充，达到表面光滑如镜面的效果。
5、还有一种方法就是气味鉴别，用火烧檀时发出的味道非常好闻，有淡淡的檀香味，不过这个方法的破坏性就很大了，不推荐使用。
