巡护是自然保护区管理中最基础的工作，是巡护人员的主要任务。巡护的目的主要有三个，一是及时发现和制止砍伐、放牧、狩猎、捕捞、采药、开垦、烧荒、开矿、采石、挖沙、建设等人类活动二是监测自然保护区的生态系统及动植物物种等，收集相关的信息，为管理决策提供支持三是起到宣传和警示的作用，让周边社区的居民认识到保护区的重要性。
巡护的具体任务就是按照巡护计划，对保护区进行观察，记录下人类活动及野生动植物等情况，维护保护区设施，对于重要事项及时上报。日常巡护的重点应包括进入保护区的道路、人类活动频繁的地带、保护区内有代表性的生态环境等。巡护计划应当明确日常巡护的时间和次数，比如每条巡护路线每半个月进行一次巡护。除了日常巡护外，在旅游旺季、火险等级较高的时期或者根据获得的信息，也要灵活地加大巡护力度
