神舟飛船是採用三艙一段結構，即由返回艙、軌道艙、推進艙和附加段構成，由13個分系統組成。神舟飛船與國際第三代飛船相比，具有起點高、具備留軌利用能力等特點。
神舟”載人飛船全長8.86米，最大處直徑2.8米，總重量達到7790公斤。從構型上來說，由軌道艙，返回艙和推進艙以及一個附加段組成。採用的是典型的“三艙一段”式結構。整個飛船按照功能還能分為13個不同的分系統。這13個分系統都是用它的功能來命名的，它們是：有效載荷、結構與機構、熱控制、指導導航與控制、推進、電源、資料管理、測控與通訊、環境控制與生命保障、乘員、回收與著陸、儀表與照明和應急救生分系統。
這些系統分別佈置在這“三艙一段”式結構的神舟飛船中，相互分工合作，完成一次太空遨遊。
