新一被記者圍堵是在第999集
修學旅行結束了，只是工藤新一在清水寺的破案似乎還是惹來了一系列的麻煩。
雖然在修學旅行之前，灰原哀在給柯南ＡＰＴＸ４８６９解毒劑的時候，一再強調要避免被黑衣組織發現，不要出風頭。
但是新一作為一個名偵探，遇到重大案件的時候還是沒有管住自己，光明正大地前去破案了。
然而，這起案件的所有當事人恰好都是名人，於是引來了一大波記者的採訪。
結果就有人拍到了新一的破案的場景，還上傳到了網際網路上，這一下也暴露出了工藤新一服下ＡＰＴＸ４８６９卻並沒有死亡的事情。
柯南看到一大堆記者聚集在自家門口，為了防止自己變小的事情被組織發現，不得不藏在了阿笠博士家中等待風波平息。
而另一邊，在學校的灰原哀看到這則新聞之後，打電話質問新一，結果他們被小林老師叫走。
原來，他們班上的東尾瑪麗亞今天不知為何沒有來學校，小林老師很擔心她。作為少年偵探團，這幾個孩子團結同學，表示他們要去找瑪利亞。
