微信支付。新型農村合作醫療微信支付方式有兩種。一是查看當地社保部門是否開通了新型農村合作醫療的公眾賬號，然後按照流程搜索當地公眾賬號進行繳費。二是微信查詢城市服務，查找城鄉居民醫保，按提示繳費。
支付寶支付。支付寶支付類似於微信城市服務支付。也可以在支付寶的更多服務中找到城市服務，然後在城市服務中點擊社保，選擇自然人社保繳費，輸入相關信息查看後點擊支付。
在官網支付。新型農村合作醫療的繳費也可以在官網繳費。在網上找到社保局官網，找到相應的繳費模塊繳費。此外，部分地區還推出了在線支付APP，可下載後諮詢支付。
