1、生長期
硃砂桔子樹修剪可以在每年春季的二月份到三月份進行，此時正處於植株的生長期，修剪不會對在其造成太大傷害，修剪時要將桔子樹生長過多的側枝剪去，促進主幹的生長。
2、結果期
硃砂桔子樹可以在每年夏季的七月份到八月份進行，此時桔子樹的果實開始發育生長，修剪能夠提高果實的品質。在修剪的過程中，要將桔子樹生長過多的果實剪除，並將生長過密的枝條剪疏。
3、衰老期
硃砂桔子樹進入衰老期後，要將其病害枝、乾枯枝剪去，為植株節省養分，修剪後要向桔子樹傷口塗抹草木灰，避免組織液外溢，並向全株噴灑多菌靈藥劑，消滅植株上的細菌，讓傷口儘快癒合。
