因為這是屬於歷史遺留問題，是宗主國殖民權利的繼承問題。
西班牙認為西撒哈拉是屬於西班牙的他的殖民地應該劃分給到西班牙。
在歷史上由於大航海時代的開啟，全球各地的人都來到過這塊地方，開始了各反面的混戰，但因為王朝更替導致摩洛哥的中央政權對邊緣地區的控制力急劇下降，加上西撒哈拉本身就屬於貧瘠之地，缺乏吸引力，就被放任自流了。
在摩洛哥獨立之後，認為無論是保護國還是殖民地，都是帝國主義列強對摩洛哥領土的佔領，這些被佔領土自古以來都屬於摩洛哥，要求歸還被西班牙被佔的所有領土，甚至包括西班牙控制的休達和梅利利亞。
但西撒哈拉的人們認為雖然歷史上他們多次控制了這塊地方，但在幾百年的時間裏有很多國家組織和政權都統治過這個地方，對於摩洛哥人的“保護國”説法不屑一顧，認為這裏從來都不屬於摩洛哥。 但摩洛哥有法國等國支持，會在安理會對不利於摩洛哥的決議否決，現在的摩洛哥金援下好些非洲國家已經在阿尤恩設立領事館，建議非盟驅逐西撒人陣，摩洛哥是絕對不會放棄的。
現在西班牙，毛里塔尼亞和阿爾及利亞都已經先後退出了關於西撒哈拉領土的爭端。 而一直沒有放棄西撒哈拉的摩洛哥卻在實際上控制了西撒哈拉地區的大部分地方，在國際上對於這塊地方都有自己的看法，也產生不少的分歧矛盾。
西撒哈拉不被承認的原因是：
西撒哈拉是一個有爭議地區，摩洛哥聲明對此地區擁有主權，並控制大約四分之三的土地。當地的獨立武裝組織西撒哈拉人民解放陣線控治着該地區大約四分之一的土地。 聯合國多次調停都沒有達成一致決議，所以不被承認。
