一、是否屬於國家體制內。備案制就是合同制，體制外的，不是正式的。編內是體制內的，正式的。
二、單位和員工互相選擇的權限。備案制，單位和員工互相選擇的範圍更大些編制內，單位和員工互相選擇的範圍很小。
三、享受的社會保障有差別。備案制，職工按照當地有關的勞動法，可享受五險（即養老保險、醫療保險、失業保險、工傷保險、生育保險）社會保障，但沒有二金（住房公積金和職業年金）編制內，職工享受的工資待遇，按照人社部門規定的標準來計發，可享受二金五險（即養老保險、醫療保險、失業保險、工傷保險、生育保險和住房公積金、職業年金）的社會保障。
四、工作的穩定性。備案制，較穩定。編制內，很穩定。
五、享受的工資待遇。備案制，比常説的合同工的待遇提高。編制內，比備案制員工高。
