瑪雅的一些農作物具有一定的商業價值，例如可可豆和棉花。手工藝人制造了日常生活所需要的家庭生產工具和用於商品交換的產品，他們還生產並製造了食鹽、蜂蜜和染料。瑪雅人對實用品和奢侈品的需求有力地促進了區域貿易和長途貿易的發展，而這些產品既顯示出上等階層成員的高貴身份，又加強了城市自身的宗教神聖意義。
瑪雅熱帶低地是人口居住密度最大的地區，考古學家通常認為熱帶低地地區不利於農業生產的持久發展和空間拓展。高地地區土壤富含火山巖，湖泊眾多，因而農業多產，而低地地區土層薄，土質貧瘠，沒有森林植被的保護，土壤很容易因雨水沖刷而流失。
同時，瑪雅的低地地區河流湖泊較少，無法滿足全年農業生產和生活的水需求量，在乾旱季節或旱災時期農業生產和生活則變得愈加困難。針對此種情況，瑪雅人創造性地發明、拓展了諸多方法以利用低地地區環境為自身服務。水資源管理到公元700年，卡米納爾胡尤已經藉助附近湖泊建造了一些灌溉溝渠。
熱帶低地地區降雨量比較豐富，並不需要大型的水利灌溉系統，而貧瘠的北部尤卡坦地區則很難藉助湖泊建造灌溉系統。在南部低地地區的許多遺址中，考古學家已經確認了很多小型的溝渠和地下排水系統。有些時候，瑪雅人會用運河將宗教中心圍繞起來，如塞羅斯的宗教中心，這或許是出於農業和防禦的雙重考慮。
埃德茲納的運河系統是迄今為止所確認的瑪雅世界中規模最大的水利控制系統。至遲在公元100年，這種運河——水庫系統就已經建立，它流經大約23公里。運河的寬度足夠獨木舟輕便地交通往來，其水容量超過200萬立方米，在乾旱季節可以為大量的可耕種農田提供水利灌溉。同時，這些運河也可能用來養魚。低地地區更為常見的水利設施包括水井和陶土管道的阿瓜塔，或者稱為“水庫”。
有時候，這些水庫藉助礦坑建造而成，這些礦坑通常是在大規模的建設活動中形成的。後來，人們將這些坑道整理鋪平，以便利於水的貯存。這些水庫通常能在乾旱季節養活某一地區的人口，甚至在持續遭受乾旱侵襲時也能如此。蒂卡爾的阿瓜塔系統足夠支撐7萬人在乾旱季節度過120天，一旦雨水來臨，城市裏的徑流系統將引導水流回到水庫中，這樣水庫又迅速被填滿。
南部低地地區的許多遺址，如卡拉克穆爾和埃爾米拉多爾，也存在着類似的這種精細複雜的蓄水系統。在一些土質並不適合建造水庫或者水流明顯低於水井水面——類似的情況在尤卡坦地區比較常見的地區，石灰石巖牀就被鑿刻成名為楚爾圖尼斯的地下蓄水池，以便在雨季收集雨水。瑪雅也有能夠儲存水的天然窪地，它們被稱為巴霍斯，但是這些存水在整個乾旱季節會以極快的速度完全蒸發掉。
為了降低這些季節性沼澤的蒸發速度，瑪雅人在水面種植了睡蓮，還挖掘了很多水井和楚爾圖尼斯，一直挖到很深的池底，以擴大其蓄水量。至今依然留存在卡瓦的狹窄湖泊最初可能正是被擴充的巴霍斯。土壤保持與集約耕作在瑪雅文明存續的大部分時間裏，季節性的泛濫而非乾旱對多數低地地區而言，是一種極大的困擾。
對居住在太平洋沿海地區的居民來説，這也是一個問題，在這些沿海區域中，瑪雅地區以及伯利茲北部和金塔納羅奧南部的新河與翁多河沼澤地帶的雨水意味着豐收洪水通常是沿着坎佩切州的坎德拉里亞河地區、烏蘇馬辛塔河以及南部低地地區的帕西翁排水網絡系統氾濫。
在上述瑪雅地區，人們採取了一些方法解決洪水氾濫問題：排幹農田裏的水，同時修造高崗農田。排水裝置修建在農田當中，被挖掘出來的土通常堆放在同一塊農田裏，因此人為造成的農田高崗部分要高於漫灘或者沼澤眾多的排水溝渠構成了運河系統。這些農耕體系能夠有效地控制灌溉用水，同時保留富含肥料的土壤，但是需要投入大量的勞動力。
這些耕地也可以進行全年的細耕種植，耕地表層覆蓋的是富含養料的運河河底淤泥。這種集約農業不僅生產用以維持生計的玉米，而且也生產用來出口的一些農作物，尤其是可可。一些運河有25米寬，一塊單獨的大型高崗田地的面積通常為200平方米。
目前，古植物學家和考古學家對瑪雅人利用人造田的準確地區，以及他們採取類似的集約耕作的準確時期產生了激烈的爭論。但是，類似的系統已經被充分證明確實存在過。在瑪雅地區，大雨的破壞作用遠遠大於河流漫灘。從尤卡坦到中部的佩滕地區，瑪雅山脈以及南部地區的高地，起伏的山丘和有坡度的地形中農業耕地的表層土壤都被雨水沖刷掉了。
人們用石頭圍成梯田，並修造了一米高的平台，以阻止自然侵蝕，防止水土流失。考古學家在從太平洋大陸（斜）坡地區到里奧貝坎地區的丘陵地帶發現了數以千計的類似梯田。農耕策略瑪雅人根據自身需求以及所處環境充分地發揮了自己的智慧，當面臨人口壓力以及商機時，瑪雅人便採用各種各樣的技術以提高他們的農產品產量。
他們採用各種各樣的農耕技術，更讓人驚奇的是瑪雅人早在前古典期就已經引進了集約耕作制度，其時間在公元前1000年左右。在養料肥厚的土壤上進行的農業耕種，例如在科潘流域的衝擊土壤或者在薩爾瓦多富含火山灰的土地以及沿太平洋的沿海地區，並沒有像在濕地或常年缺乏灌溉用水的地區那樣對環境非常依賴。
有證據表明，這些養料肥厚的土地是連年耕種的，這一點暗示出莊稼的輪耕以及肥料應用等方面的信息，肥料通常是日常生活的廢棄物，被添加到耕地當中以增加土壤的肥力。傳統的種植方法是將富含氮的豆類與玉米並排耕種，這種種植方法會產生非常實用的效果，即生長中的玉米可以吸收氮。
在沒有人口壓力的地區，臨時性的耕田——也就是指經簡單清理割除、燒除植被後開出的田地，這種農田在一年的種植之後要有一個休耕期（兩年到四年）——即可以滿足瑪雅人的糧食供給。直到20世紀70年代，考古學家一直認為，所有前西班牙時期的農業與在現代瑪雅村莊所能看到的臨時性農田耕作基本相同。然而，現在我們知道，在哥倫布發現美洲之前的時期裏，瑪雅人的耕作方式是極其複雜的。
結語
如果沒有上面所描述的具有創新意義的水土管理制度體系，古代瑪雅人是不可能定居在內陸低地地區或者其他邊緣地帶的，也不可能供養古代瑪雅文明中數量巨大的城市人口，或者出口大量的糧食。臨時性田耕農業每平方公里的農作物產量可以供養77個人，但是，這並不是瑪雅古典期晚期社會的衡量標準，當時在一些較大規模的城市當中這一標準變化很大，每平方公里的農作物產量可以供養700個人。
