科學家們從木乃伊身上獲得了母子遺傳中的DNA線粒體變異信息。由於DNA污染，研究團隊只從3具木乃伊身上提取了詳細的核心DNA信息，是來自父母雙方的遺傳。
這兩組不同類型的DNA材料結論是，古埃及人與現代的撒哈拉沙漠以南的非洲人，有很少的相似基因。相反，古埃及人親緣最近的人羣，在新石器和青銅時代居住在中東的黎凡特（Levant），即托羅斯山脈以南、地中海東岸、阿拉伯沙漠以北和上美索不達米亞以西的一大片地區。研究顯示，古埃及人與古歐洲人、以及居住在黑海和地中海之間安納托利亞半島的古代人類有着更為密切的親緣關係，甚至比與現代埃及人的基因更為接近。
