外觀不一樣，仲尼式古琴要比伏羲式古琴的棱角更加顯明一些，一般來說，聲音也要比伏羲式古琴要更大一些。而伏羲式古琴的聲音要比仲尼式古琴的聲音更加渾厚一些。
初學者挑選一張仲尼式古琴，也是對文化歷史的尊重，所以多數人用仲尼式古琴學琴。
伏羲式古琴保留了唐琴大而渾圓的音質特色，可以安撫人的心性。
所以，兩種古琴各有特色，彈琴人可以根據自己的喜好進行選擇！
1、仲尼式古琴屬於古琴中最常見的一款樣式，屬於聖人造琴的類別。由於它的名字叫“仲尼”，所以人們總會將它和孔子聯繫起來，雖然不能確定這種式樣是否是孔子設計，但以“仲尼”命名的確很恰當，因爲它是在所有琴裏最簡潔的一種，只在琴體的腰部和頭部有兩個凹進的線條，通體沒有任何其他的修飾，它的簡捷而流暢、含蓄而大方的造型最能體現儒家思想的中庸內斂的風格。
2、伏羲式也是聖人造琴的一種，形狀與神農式非常接近，相傳爲伏羲氏所創。他的特點是在琴的下部起彎的地方多了一個彎，即：有兩個連續的彎，琴體外形的其他部位與神農式相似。
兩者的不同之處：
1、在音色上，伏羲氏比仲尼式聲音要渾厚一點。因爲伏羲氏主要保留了唐琴大而渾圓的音質特色，因此聲音較仲尼式古琴更加具有厚重感而仲尼式古琴在宋代開始興盛並流行起來，這是因爲宋代的詞曲更加婉轉悠揚，因此仲尼古琴那種纖細、細膩的音質更加契合宋詞的風格。因此，仲尼古琴較之伏羲古琴音域更加寬廣，音色更加明亮。
2、在外觀上，伏羲式的頸部一個彎曲，腰部兩個彎曲。不雷同。有靈氣仲尼式的中正平和，讓人看着就不自覺地肅然。
