清明節前後或植株落葉前，根據單株用藥量計算出全部植株的用藥總量，然後將藥劑兌水稀釋成合適的濃度進行灌根即可。灌根可用生物菌劑配上生根粉來澆灌，也可加入適量殺菌劑，例如惡黴靈或者甲霜靈，都可起到輔助殺菌的作用。
灌根注意事項
1，使用殺菌劑灌根後，如果出現藥害，可以澆水進行補救，一般是迅速溜一次小水，稀釋土壤中藥劑的濃度，再噴施一些緩苗提苗的激素類藥物，幫助植株迅速恢復長勢。
2，要保證藥液迅速全面的達到發病部位。譬如在莖基部發生的病害，如疫黴根腐病、莖基腐病等，可以直接噴灑莖基部再進行灌根。
3，灌根後一般幾天內不要立即澆水，否則會稀釋藥液濃度甚至會流失藥液，起不到真正的殺菌治病的作用。
4，使用殺菌劑灌根前幾天也不要澆水。作物的根部病害已經發生，澆水時病菌會隨水進行傳播，造成更大面積感染，更多植株患病。澆水還容易導致土壤通透性下降，根部缺氧，漚根。抗逆性降低，病菌更容易感染，灌根後藥液更難往下滲透，而且藥液濃度還降低。
