明因寺起初由正建和尚独力募捐建成，后为当时高僧、乌江县非渡和尚的阅经寺。继而有通明法师与江南高僧在此开坛、传戒、说法、誉满大江南北。后其徒宋权、宋镜等感其恩德，遂募捐重建该寺。
南京明因寺
清咸丰（1851～1861年）年间，明因寺不幸毁于战火。同治（1862～1874年）年间得以重建。重建后的明因寺占地数十亩，有大雄宝殿、藏经楼、禅堂、罗汉堂等建筑，十分雄伟壮观。寺字面积甚大，民间有“骑马转山门”之说。
昔日的明因寺，曲径通幽，古木参天，绿草如茵。每当霜降以后，漫山遍野的枫树红叶艳如晚霞，以“明因秋色”之景列于“桥林十二景”之首。明因寺香火甚旺，前来焚香、拜佛、求签、许愿的信众络绎不绝。年终岁首或菩萨生诞，信众聚集，更是人山人海。最有意思的是，明因寺曾供奉有黄姓和尚的肉身金像，须眉清晰。栩栩如生，民间称其为活佛，盛传其灵感普现云云。1951年，明因寺被征作办学之用，肉身金像被送往狮子岭兜率寺供奉。
明因寺原址已改为桥林中学、小学的校址，1997年易地重建。现有三圣殿5间、寮房4间，占地8亩。住持为性空法师，现年70岁，浙江萧山人，39岁出家于江苏高邮，47岁在安徽九华山求授大戒，1998年来明因寺担任住持。寺内现有比丘6人。
