双核反渗透净水器出水水质也要比超滤净水器好得多，出水水质和卫生部门的检测标准不同，例:出水细菌指标，超滤净水器按“一般水质处理器”，菌落总数为100个/毫升。而反渗透净水器为20个/毫升。
双核反渗透净水器有浓缩水产生，纯水供饮用浓缩水(废水)供洗涤用。而超滤净水器一般用作洗涤用水，当自来水水质很好时也可用作饮用水。 反渗透净水器的优点是:水质安全能去除水中各种有害杂质，对供水特发事件效果较好。出水口感较好，能降低水的硬度，煮水容器不结垢。 反渗透净水器其缺点是:用泵、需通电，有电气安全问题。接头多、水压高，故障率及漏水概率相对较高结构复杂、价格较贵。
