简单来说，这个终极秘密就是长生。
《盗墓笔记》从头到尾的剧情安排都是跟人的寿命有关，刚开始是解释张起灵为什么可以容颜不老，到了后面又开始替吴邪治病，帮他续命。
一般来说，小说中反复出现的人物就是故事里的主角，同样小说里反复出现的故事线就是该小说的主角，而《盗墓笔记》反复出现的字眼也就是长生，所以这终极的秘密，其实就是长生的秘密。
往复杂了讲，《盗墓笔记》的终极秘密谜，是“一个终极三条迷线”
一个终极：长白山地底大铜门——中华文明的源头，伏羲古氏族文明
三条贯穿始终的迷线：第一条：史前青铜文明——蚩尤——广西——闷油瓶——失忆的一条迷之线。
第二条：盗墓笔记的大主线：古代长生秘密的发展。
第三条：盗墓笔记的大主线：现代各种力量关于长生秘密的博弈，中华文明的起点，就在长白山，这就是终极。
按正规历史的说法，中国青铜器时代始于夏朝，鼎盛于商周，但现在的史前考古，显然推翻了这点，远在远古时期，中华就出现过高度的青铜文明，有一种说法，蚩尤是史前青铜文化的创始者，而三星堆，正是蚩尤的后裔建造的。
终极的秘密是:三叔设定的长生不老。
另外，关于终极的猜测还有:
①三叔自己都没想好的脑洞。
②虫洞，通往另一个世界的神秘通道。
③预见未来，有读者猜测每个人看见的终极都不一样，因为每个人的未来不一样。
是人蛇共生的秘密。也就是不老=死循环。
伏彝是中国人的祖先，他死后中国势力分为三部分，即黄帝，蚩尤，西王母，万奴王。先是黄帝打蚩尤，西王母助黄帝夺得中原，于是蚩尤西迁，成了今天苗族的后代。
