16S rRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长（包含约50个功能域）。随着PCR技术的出现及核酸研究技术的不断完善，16S rRNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具。数据库的不断完善，应用该技术可以实现对病原菌进行快速、微量、准确简便地分类鉴定和检测。该技术主要有三个步骤：首先是基因组DNA的获得，其次是16S rRNA基因片段的获得，最后是进行16S rRNA基因序列的分析。
核蛋白体RNA( ribosomal RNA， rRNA)是细胞内含量最多的RNA，约占RNA总量的80%。rRNA与核蛋白体蛋白(ribosomalprotein)共同构成核蛋白体(ribosome)。核蛋白体中的rRNA和核蛋白体蛋白共同为蛋白质生物合成所需要的mRNA、tRNA以及多种蛋白因子提供了相互结合和相互作用的空间环境。
原核生物有三种rRNA。依照它们的沉降系数可分为5S、16S、23S。它们分别与不同的核蛋白体蛋白质结合分别形成了核蛋白体的大亚基(largesubunit)和小亚基(smallsubunit)。真核生物的四种rRNA也利用类似的方式构成了核蛋白体的大亚基和小亚基。
