主流洪水期大致始于10至11月，次年3至6月进入最高洪水期，6月以后逐渐减退，至9月最低。个别年份因雨季变动而使南北支流洪水同时发生，主流便出现特大洪峰，如奥比杜斯附近曾记录到每秒280000的流量。
由于中、下游平原地势低，河流比降微缓，流速较慢，一到洪水季节河水宣泄不畅，水位平均上涨幅度9米多，洪泛宽度25至80公里，河口地区可达240公里，呈现一片汪洋，因此亚马逊河素有“河海”之称。
亚马孙河南岸支流洪水期在11月至次年5月，北岸支流洪水期在3～8月。亚马孙河的涌潮可沿河上溯1000多千米。亚马孙河因为位于热带雨林地区，气候是热带雨林气候，全年高温多雨，没有明显的汛期，这就导致了亚马孙河没有明显的涨潮时间。
但是汛期也有，亚马逊河流域地跨赤道，由于赤道附近多雨地区，亚马逊水量终年充沛，流域内降水季节变化较小，主流洪水期大致始于10至11月，次年3至6月进入最高洪水期，6月以后逐渐减退，至9月最低。
