有两种原因：一是番茄叶霉病引起的黄斑。叶霉病在春季番茄种植后期棚室温度升高后，再遇湿度大时易发生。叶霉病病菌在叶面有水滴的条件下即可萌发，这也是菜农为何浇水后发病严重的原因。湿度大于80％时有利于该病发生，是一种高温高湿型病害。另外一种原因是在番茄苗期喷施过矮壮素。矮壮素是一种激素类药物，对浓度的准确度要求较高，菜农在配制过程中往往出现浓度偏高的现象，造成黄斑发生。
西红柿上出现大片的黄斑主要是由于根腐病、枯萎病和生理性死株造成植株慢性死亡，未来得及成熟的果实在变红过程中由于营养供应不充足，茄红素形成量少造成的。
