硝化细菌的存活条件是培养硝化细菌的重要环节，它们所需要的水分以及很高的氧气，是鱼类生存的必要条件。但是硝化细菌是必须要寄存在各种微小细孔的滤材中的，所以水中的滤材是必不可少的。
硝化细菌生存的温度在5~35度，所以它们在寒冷的冬天也是会工作的。只是降低了工作效率而已，最好将温度维持在25度左右，这个温度恰好也是大多数热带鱼的生存温度。
很多人培养硝化细菌失败，可能是忽略了这一点。就是缸体的容量要和养鱼的数量，还有鱼的体型成正比，不可小鱼缸养了体型较大的鱼或是鱼的数量过多，这样造成的问题就是鱼产生的粪便或食物残渣，超过了硝化细菌的处理能力，导致系统失衡。
