农村有房在城市买房不算二套房。个人名下的房产是以在当地的房管局是否备案的为准，农村自建的宅基地房屋在房管局是没有备案的，所以在房管局是可以开出无房证明的，在城市买房是属于个人首套房的待遇。
农民的宅基地是受法律保护的，严格来说城里人是不能到农村进行房产投资的。对几套房等限购措施那是相对商品房等城市房产。
当然如果农村的房屋，如果在当地房管局有备案，在城市买房的话可能也会算二套。
当然要算的！否则就是违章建筑。这个问题自我国成立以来，就由农村的初级人民公社统一规范了土地房屋的统计，划归了集体所有，属于地上的“浮财”也既是归人民公社集体所有，我国的第一部宪法做出了明确的界定。以后不断的修改与补充，得到了充分完善。并且农村的宅基地也都是要颁发给你房屋产权证的。
现在农民要自筹自建房，那要向村及乡镇两级部门备案，得到审批后才可以建造房屋的。凡是私自建造那既是属于违建，必须要被强行拆除的！
如果农村的房产没有房屋产权证的算一套房，否则就算二套房。
《关于规范商业性个人住房贷款中第二套住房认定标准的通知》中确定了二套房认定标准：一、商业性个人住房贷款中居民家庭住房套数，应依据拟购房家庭(包括借款人、配偶及未成年子女，下同)成员名下实际拥有的成套住房数量进行认定。
二、应借款人的申请或授权，直辖市、计划单列市、省会()城市及其他具备查询条件的城市房地产主管部门应通过房屋登记信息系统进行借款人家庭住房登记记录查询，并出具书面查询结果。
如因当地暂不具备查询条件而不能提供家庭住房登记查询结果的，借款人应向贷款人提交家庭住房实有套数书面诚信保证。贷款人查实诚信保证不实的，应将其记作不良记录。
三、有下列情形之一的，贷款人应对借款人执行第二套(及以上)差别化住房信贷政策：
(一)借款人申请利用贷款购买住房，如在拟购房所在地房屋登记信息系统(含预售合同登记备案系统，下同)中其家庭已登记有一套(及以上)成套住房的
(二)借款人已利用贷款购买过一套(及以上)住房，又申请贷款购买住房的
(三)贷款人通过查询征信记录、面测、面谈(必要时居访)等形式的尽责调查，确信借款人家庭已有一套(及以上)住房的。
四、对能提供1年以上当地纳税证明或社会保险缴纳证明的非本地居民申请住房贷款的，贷款人按本通知第三条执行差别化住房信贷政策。
对不能提供1年以上当地纳税证明或社会保险缴纳证明的非本地居民申请住房贷款的，贷款人按第二套(及以上)的差别化住房信贷政策执行商品住房价格过高、上涨过快、供应紧张的地区，商业银行可根据风险状况和地方政府有关政策规定，对其暂停发放住房贷款。
五、各地要把城市房屋登记信息系统建设作为落实国发〔2010〕10号文件的一项重要工作抓紧抓好。数据不完备的城市，要进一步完善系统尚未建立房屋登记系统的城市，要加快建设。2010年年底前各设区城市要基本建立房屋登记信息系统。
