上级单位来检查是配合还是陪同

配合。

上级单位来检查，有时会通知也有不通知的。被检查单位到时须按上级要求，配合提供常规资料：用工、财务、安全消防、环保等，并予以说明，需到现场的，带到现场，检查后需要整改的，配合进行。

总之，上级合规合法的检查，被检查单位原则上要配合，不得拒绝、隐瞒事实、选假等。