1、形式上的区别：
独立主格结构：名词/代词+to do/doing/done分/形容词/副词/介词短语。
例如：Book in hand， he came in hand是状语，in hand的逻辑主语是book而不是句子的主语he，这种状语就是独立主格结构
非谓语动词是指
to do、doing和done（现在分词和过去分词），即动词的非谓语形式。
2、作用的不同
独立主格结构在句子中只作状语，表时间、原因、条件、伴随、目的及状态等。
例如：My shoes removed，I entered a low-ceilinged room，treading cautiously on the soft tatami matting．
我脱掉鞋子后，走进一间屋顶很低的房间，小心翼翼地踩在柔软的塌塌米垫子上。
非谓语动词除了不能独立作谓语外，可以承担句子的其它成分。
例如：Seen from the top of the hill， the city is from the top of the hill是状语，句中is是谓语，seen是过去分词，属于是非谓语动词。
两者有些关联，也有些区别。
1、非谓语动词包括动词不定式，现在分词和过去分词
2、但是动词不定式，一般不用在独立主格结构之中。现在分词和过去分词可以用在独立主格结构之中。
3、在一般的情况下，现在分词或者过去分词的逻辑主语就是主句中的主语。比如：
① He often lies on bed reading.（此处的现在分词reading这个动作是由句子的主语he完成的， reading的逻辑主语就是he）
② Given more care， the flowers can grow better.（这花如果被给予更多的照料，会长得更好。 Given的逻辑主语就是flowers）。
4、如果现在分词和过去分词的逻辑主语不是主句中的主语的时候，我们通常要用独立主格结构。如
①It being a rainy day， we all felt uncomfortable.（现在分词并的逻辑主语是天气，而主句中的主语是we）。
② The shirt washed， the man sat at the desk reading with a bare back.
可以概括的说独立主格结构就是 一种特殊的分词用法，当分词有自己的逻辑主语，而不是主句中的主语的时候，此时的分词用法就是独立主格结构，比如上述的第3点，属于分词的一般用法，第4点属于分词的特别用法，叫独立主格结构。
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