1、选择春、夏、秋三个季节，采摘成熟饱满的种子，在阴凉平坦的山坡上挖二十厘米深的地窖，用湿湿的沙子将种子埋在地窖内，如果山坡不够阴凉，要搭棚子防止阳光照射，然后静待黄连种子发芽。
2、在高处平整地方做畦，畦上也要搭棚遮蔽阳光，但要让雨水能够淋进来，种子出现裂口后播种，然后用牛粪或马粪加以覆盖，大约三个月后，种子出苗，出苗后的黄连要勤于管理，清除里面的杂草，让苗茁壮成长。
3、苗期应施肥促其生长，施肥时使用能迅速发挥作用的氮肥，过冬时，在苗上撒上腐殖土或牛马粪，增加温度，为苗保暖，防止苗冻伤或冻死。
4、播种后第三年，小苗就可以进行移栽了，移栽具体时间以长出四片到六片叶子为宜，可以成片栽种，也可以采用套种的方法，套种的植物有桑、麻，还可以和高大的杉树、松树等栽在一起。
5、如果黄连套种的是玉米，在玉米成熟后，将玉米秸秆留下，编织成棚状，能够为黄连营造阴凉的生长环境，如果是在松树林中，松树长起来后，会为黄连营造一个天然的阴凉环境。
6、收获黄连后的林间地面，还可以继续种植，种植前将地面修平，施足底肥待栽，栽后第二年，除了留种的不摘花苔之外，其余的都要摘除花苔，以确保营养的集中，黄连生长期间要及时除草，施肥，防治病虫害。
播种育苗：春播一般在2月下旬至3月中旬。挖条状沟，沟距30厘米，深3厘米。播前灌足底水，将种子均匀撒入沟内，每亩用种量4至5公斤，覆土2至3厘米，轻轻压实，上盖地膜。
苗期管理：种子出苗前，要保持土壤湿润，一般20至25天左右出苗。为提高成活率，要早间苗，第一次间苗在苗高3至4厘米时进行，去弱留强。以后根据幼苗生长发育间苗1至2次，最后一次间苗应在苗高15厘米时进行。根据幼苗的生长情况施肥，幼苗生长期以氮肥、磷肥为主，速生期氮肥、磷肥、钾肥混合，苗木硬化期以钾肥为主，停施氮肥。及时松土除草，多在灌溉后或雨后进行，行内松土深度要浅于覆土厚度，行间松土可适当加深。一般一年生苗高60至80厘米，每亩产苗2．5万株。
