滇池的水域面积缩小的原因是蒸发旺盛，过度取水，环境污染。外流湖泊面积缩小原因一般是围湖造田，泥沙淤积，和环境污染。究其原因，人为因素不容忽视。经历两个较大的转折时期，一是元代疏挖滇池出水口、海口，元、明时期多次疏挖海口河，使水位降落二是十年动乱中，在草海地区盲目地围海造田，填去近12平方公里的湖域三是过度的毁林开荒，滇池地区森林覆盖率由建国初期的50％下降到15％。近年来，滇池内总淤积量约为5610万立方米，湖盆平均指高0.48厘米，每年排入滇池的工业和生活污水约2亿立方米，也就是2亿吨左右。致使滇池水体富营养化异常严重，水葫芦疯长，水生植物群落逐年消失，失去自净能力。
