青苔和绿藻的生长环境不同，青苔生长在湿地、墙上、井中、屋瓦及水中等处。绿藻多见于淡水，常附著於沉水的岩石和木头，或漂浮在死水表面，也有生活於土壤或海水中的种类。
它们的形态特征不同，青苔色泽翠绿，茎细如丝。绿藻的体型多种多样，有单细胞、群体、丝状体或叶状体。青苔和绿藻的应用价值不同，青苔植物精致、细密、充满生机，在园林上的应用形式也丰富多样，主要应用于公园绿化、屋顶绿化、垂钓绿化和家庭园艺中，营造出优雅别致的植物景观。
绿藻门的经济价值很高。贮藏的营养物质主要为淀粉和油类，有的绿藻可作为药用，此外利用藻菌共生系统和活性藻的方法来处理生活污水和工业污水。
