光合作用包括两个阶段：光反应(场所为叶绿体的类囊体薄膜)和暗反应(场所为叶绿体基质)，光反应阶段性是水的光解，暗反应阶段包括C3的还原和CO2的固定。
光反应阶段：2H2O+2NDAP+ + ADP +Pi→(光，酶)O2+2NDAPH + 2H+ ATP
暗反应阶段：2C3+[H]→(酶，ATP) (CH2O) +C5 C5+CO2→酶2C3
光合作用第一步就是水的光解.在叶绿体的类囊体上，水被分解为氧和还原氢，氧作为光合作用的第一个产物被释放出去，而生成的还原氢则参与暗反应，将三碳化合物还原成有机物.
