中建科工隶属于中建集团，和各个工程局平级中建科工集团有限公司（原中建钢构有限公司）是中国最大的钢结构产业集团、国家高新技术企业、国家知识产权示范企业，隶属于世界500强中国建筑股份有限公司。
中建科工和中建三局的关系应该是兄弟单位之间的关系。中建三局也是属于中国建筑股份有限公司
区别在于
中建三局建设工程股份有限公司是上市公司。中国建筑第三工程局有限公司是中建三局建设工程股份有限公司的主发起人，也是其母公司，控股方。中建三局是他们的简称。
另外，中国建筑第三工程局有限公司的母公司是中国建筑股份有限公司。
