二者的主要区别如下：
第一、硅油与柴油的来源及结构不一样：其中硅油是化工合成的化学产品线型聚硅氧烷，而柴油是则由石油提取馏分调配而成的复杂烃类混合物。
第二、 硅油与柴油的物理性能不一样：其中硅油一般是无色（或淡黄色）、无味、无毒、不易挥发的液体，具有耐热性、电绝缘性、耐候性、疏水性、生理惰性和较小的表面张力，此外还具有低的粘温系数、较高的抗压缩性、有的品种还具有耐辐射的性能而柴油一般是茶黄色或者棕褐色，有特殊的柴油味，挥发慢，手感光滑。
第三、硅油与柴油的功能用途不一样：其中硅油的应用范围非常广泛，它不仅作为航空、尖端技术、军事技术部门的特种材料使用，而且也用于国民经济各部门，其应用范围已扩大到：建筑、电子电气、纺织、汽车、机械、皮革造纸、化工轻工、金属和油漆、医药医疗等等而柴油的应用范围相比就狭窄许多，其最重要用途是用于车辆、船舶的柴油发动机。
硅油通常指的是在室温下保持液体状态的线型聚硅氧烷产品。一般是无色（或淡黄色）、无味、无毒、不易挥发的液体。硅油不溶于水、甲醇、乙二醇和2-乙氧基乙醇，具有很小的蒸汽压、较高的闪点和燃点、较低的凝固点。
柴油则是轻质石油产品，是复杂的烃类混合物，为压燃式发动机（即柴油机）燃料。柴油有浓烈的气味，不同规格的柴油颜色也不一样，有的是黄色的，也有无色的。
另外硅油和柴油的最大区别是，硅油是人工合成的，柴油是从石油中提炼的。硅油具有广泛的用途，在很多工业领域和生产生活中都能用上。柴油的用途是用于车辆、船舶的柴油发动机。
