南通通州湾归南通市管。现通州湾所辖区域原为南通市通州区的三余镇，海晏镇及北兴桥镇，后南通市为进一步扩大海洋经济，提升城市未来规模，将该三镇统一变更为现在的通州湾，与原通州区平级均为正处级行政单位，但通州湾的下属行政机构设置人员偏制规模较小。
江苏省通州湾江海联动开发示范区（简称“通州湾示范区”）地处长三角核心区、长江经济带与沿海经济带交汇处，规划总面积820平方公里，控制范围面积585平方公里（其中，陆域面积292平方公里、海域面积293平方公里，主要包括原通州区三余镇、滨海新区以及如东县大豫镇两村一居、东安科技园）。
