窗边的小豆豆中巴学园和别的学校的课堂不同、午餐不同、户外活动不同、运动会不同。
1、课堂不同
巴学园课堂中，每个学生没有固定的座位。每天上午上课的时候，老师会把所有的课程写在黑板上，不设定每个课程的固定时间。学生根据黑板上的内容去自主的学习，遇到不懂的题目可以随时问老师，唯一的要求是学生必须在上午把所有的内容完成。
2、午餐不同
巴学园的小林校长要求学生从家中带来的午餐必须包含两样：海里的东西和山里的东西。海里的东西就是海鲜类，山里的东西就是陆地上的食物。每天午餐之前，校长会检查每位学生的饭盒，看看是不是缺这两样食物。如果缺少的话，校长会让食堂为学生补充，目的是午餐的营养搭配。
在午餐之前，校长会要求一位学生来讲故事。不论故事讲得好与不好，校长和学生都会鼓掌给予鼓励。校长的目的是锻炼学生的表达能力和敢于说出内心想法的勇气。
3、户外活动不同
老师带领着学生去野外进行户外活动，路上会遇到一些历史建筑和花草树木。老师给学生们讲花草树木的一些知识，还有关于历史方面的故事。在学生玩耍的同时，老师把知识传授给了学生。在学生接近大自然的同时，也提高了孩子们的学习兴趣。
校长会带学生去农田，让种地的老伯伯给学生讲种植庄稼和除草的知识，和农田中的昆虫、鸟、蝴蝶和气候方面的知识。
4、运动会不同
巴学园的运动会与众不同，除了拔河等基础类的项目，还有很多项目是校长亲自设计的。其中有些项目是为了一位有生理缺陷的学生设计的，而这位学生在这些项目中拿了冠军。
后来小豆豆无意中听到校长和老师的谈话，知道了校长亲自设计这些项目为了让这位学生消除内心的自卑心理，增强自信心。
