两者外形上有所不同，尾巴也有不同
1．蜥蜴下颌骨的左右两半以骨缝结合，不能活动，口不能张大。石龙子的下颌骨左右两半以韧带相连，彼此间可拉开。
2．蜥蜴多具有活动的上眼睑和下眼睑，眼睛可以自由启闭。石龙子的上下眼睑愈合为一透明的薄膜，罩在眼睛外面。
3．蜥蜴一般都有外耳孔，即使没有，也可从外表看出鼓膜的所在。石龙子没有外耳也没有鼓膜，所以外表上看不出听觉器官的痕迹。
4．蜥蜴的尾巴都较长，一般约等于（或仅略短于）头体长，或为头体长的2~3倍。石龙子的尾巴相对较短，为体长的 1/2到1/4（即尾长占全长的1/ 3 ~1/ 5）。
