第一展厅为植物、矿石厅。展出41科104种植物标本，植物标本有国家级保护的银杏、南方红豆杉、银钟花、观光木等珍稀树种有井冈山特有的井冈山槠、井冈山杜鹃、井冈山厚皮香、井冈寒竹等。展出矿石标本135种。矿石标本有黄金矿、钨矿、磁铁矿、黄铁矿等矿物标本。
第二展厅为兽类、爬行及两栖动物厅。展出标本121种，有国家级保护的梅花鹿、短尾猴、金猫、穿山甲、水鹿、大鲵(娃娃鱼)等井冈山常见的豪猪、竹叶蛙、弹琴蛙、竹叶青蛇、丽纹蛇等和井冈山特有的井冈山脊蛇等。
第三展厅为鸟类昆虫厅。展出标本440余种，有国家级保护的黄腹角雉、白颈长尾雉、白鹇、褐冠鹃隼、领头号等有大家熟悉并喜欢的红嘴相思鸟、蓝翡翠、金腰燕、大苇莺等，五颜六色的昆虫标本更是令人喜爱，过目难忘。
