药剂防治。当田间发现有零星锈病为害时，宜及时亩用25％腈菌唑20-30毫升，或25%三唑酮800-1000倍液或25%丙环唑40-50毫升或25%醚菌酯40克，或40%氟硅唑15-20毫升等轮换交替喷施防治两次七天一次，对于田间有明显发病中心的，宜及时拔除发病中心植株在进行喷药防治。连防两到三次，五到七天可以有效防控其为害。
谷子锈病主要为害叶片，会形成大量铁锈状粉末，发生严重时可以使叶片及植株枯死，严重影响产量，一般在7-9月降雨较多时容易发生。生产上还可以通过科学施肥，不易氮肥偏多过旺使用，并适期播种及时排水等也可以减轻其发生为害。
